A formação histórica do litoral Norte tem como referência a presença de indígenas, fixados principalmente a beira das águas doces e salgadas. A entrada de negros africanos foi simultânea com a colonização de origem portuguesa. O Tupi-Guarani fixou-se definitivamente na região.

Em 1840 iniciou a colonização do município situado no vale do Rio Maquiné, com a vinda de Antônio Leonardo Alves, procedente da família Abreu.

A chegada de novas famílias viriam no final do século ado com colonizadores alemães, italianos e poloneses, dando novo impulso à produção primária.

Em 1914, com a construção de um pequeno porto na fazenda do Leonardo, a localidade ou a chamar-se de Porto Cachoeira. Em 1938 foi denominada Vila General Daltro Filho, nome que gerou divergências políticas, dois anos após foi rebatizada para Maquiné.

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Em divisões territoriais datadas de 31-XII-1936 e 31-XII-1937, figura no município de Osório o distrito de Cachoeira.

No quadro fixado para vigorara no período de 1939-1943, o distrito de Cachoeira, figura no município de Osório.

Em divisão territorial datada de 1-VII-1960, o distrito de Cachoeira permanece no município de Osório.

Assim permanecendo em divisão territorial datada de 1988.

Elevado à categoria de município com a denominação de Maquiné, pela Lei Estadual n.º 9.531, de 20-03-1992, desmembrado de Osório. Sede no antigo distrito de Maquiné. Constituído do distrito sede. Instalado em 01-01-1993.

Em divisão territorial datada de 1995, o município é constituído do distrito sede.

Pela Lei Municipal n.º 239, de 19-08-1996, foram criados os distritos de Barro do Ouro e Morro Alto anexado ao município de Maquiné.

Em divisão territorial datada de 2001, o município é constituído de 3 distritos: Maquiné, Barro do Ouro e Morro Alto