A cidade de Alagoinhas teve seu primeiro povoamento nos fins do século XVIII, quando um padre português fundou uma capela no seu território.

O nome de Alagoinhas originou-se dos rios (Sauípe, Catu, Subaúma, Quiricó), lagoas e córregos existentes na região.

O poço de petróleo MG-1-BA foi descoberto em 1964. Gás natural e petróleo começaram a compor, naquele momento, a vida econômica e social de Alagoinhas. Em 1967 já eram mais de 30 poços no município.

A Ferrovia e o petróleo contribuíram para o desenvolvimento do comércio de Alagoinhas. A cidade se voltou para os serviços e se tornou pólo para mais de 30 municípios vizinhos. A localidade cresceu de forma desordenada, sem que houvesse um planejamento que orientasse a adequação da sua infra-estrutura às necessidades da comunidade. Entre os problemas mais graves enfrentados pela comunidade podiam ser apontados os causados pela deficiência da pavimentação urbana, os serviços de saúde, que não se adequavam às normas do SUS, e à escassez de o ao saneamento básico.

Formação istrativa 5x5b1n

Distrito criado com a denominação Alagoinhas, pela Lei Provincial n.º 1.248, de 28-06-1872, subordinado ao município de Inhambupe.

Elevado à categoria de vila com a denominação de Alagoinhas, pela Lei Provincial n.º 442, de 16-06-1852, sendo desmembrado de Inhambupe. Constituído do distrito sede, instalado em 02-07-1853.

Pela Lei Provincial n.º 1.135, de 28-03-1871, é criado o distrito de Igreja Nova e anexado à vila de Alagoinhas.

Pela Lei Provincial n.º 1.239, de 21-06-1872, é criado o distrito de Araçás e anexado à vila de Alagoinhas.

Pela Lei Provincial n.º 1.861, de 27-05-1879, é criado o distrito de Aramari e anexado à vila de Alagoinhas.
Elevado à condição de cidade, com a denominação de Alagoinhas, pela Lei Provincial n.º 1957, de 07-07-1880.

Em divisão istrativa referente ao ano de 1911, o município aparece constituído de 5 distritos: Alagoinhas, Aramari, Araçás, Igreja Nova e Riacho da Guia.

Assim permanecendo em divisões territoriais datadas de 31-XII-1936 e 31-XII-1937.

Pelo Decreto-lei Estadual n.° 141, de 31-12-1943, retificado pelo Decreto Estadual n.° 12978, de 01-06-1944, o distrito de Igreja Nova recebeu a denominação de Boa União.

Em divisão territorial datada de 1-VII-1950, o município é constituído de 5 distritos: Alagoinhas, Aramari, Araçás, Boa União (ex-Igreja Nova) e Riacho da Guia.

Assim permanecendo em divisão territorial datada de 1-VII-1960.

Pela Lei Estadual n.º 1.473, de 06-09-1961, é desmembrado do município de Alagoinhas o distrito de Aramari, e elevado à categoria de município.
Em divisão territorial datada de 31-XII-1963, o município é constituído de 4 distritos: Alagoinhas, Araçás, Boa União e Riacho da Guia.

Assim permanecendo em divisão territorial datada de 1988.

Pela Lei Estadual n.º 4849, de 24-12-1989, é desmembrado do município de Alagoinhas o distrito de Araçás, elevado à categoria de município.

Em divisão territorial datada de 1991, o município é constituído de 3 distritos: Alagoinhas, Boa União e Riacho da Guia.

Assim permanecendo em divisão territorial datada de 2014.